mirna的靶基因是什么
miRNA的靶基因是miRNA所能选择性识别和结合的mRNA序列。miRNA通过配对和互补碱基对结合于目标mRNA的3'非翻译区(3' UTR)或编码区,从而主要通过抑制靶基因的转录或翻译来实现调控作用。miRNA与靶基因的配对可以是完全互补或部分互补,部分互补配对即带有一定的错配。具体的miRNA靶基因取决于miRNA的序列、结构和表达情况。
根据miRNA靶基因的预测方法,主要包括以下几种策略:
1. 通过计算和比对:利用计算算法和数据库,预测miRNA与靶基因mRNA之间的互补配对。这种方法包括基于序列保守性分析、RNA二级结构预测和碱基局部稳定性等特征的方法。常用的数据库包括TargetScan、miRanda和miRDB等。
2. 实验验证:通过实验手段来鉴定miRNA靶基因。这种方法包括免疫沉淀、RNA交互作用筛选、基因表达芯片、蛋白质质谱分析等技术。这些技术可以直接检测miRNA与靶基因的相互作用,并确定miRNA调控的靶基因。
需要指出的是,miRNA与靶基因的关系复杂且多样,一个miRNA可能同时调控多个靶基因,一个靶基因也可能受到多个miRNA的调控。因此,准确预测和鉴定miRNA的靶基因是一个仍然面临挑战的研究领域。