植物总rna提取
植物总RNA提取是从植物样本中提取包括mRNA、rRNA和tRNA在内的全部RNA的常规实验操作。以下是一种常见的植物总RNA提取方法:
材料和试剂:
1. 植物样本:如叶片、茎、根等。
2. TRIzol试剂(或类似的RNA提取试剂)。
3. 液氮或干冰。
4. 离心管和离心机。
5. RNase-free试剂和工具。
实验步骤:
1. 准备样本:
- 收集新鲜的植物组织样本,并尽量快速地将其置于液氮或干冰中以保持RNA稳定。
- 如果样本不是立即处理,可以将其在液氮中冷冻并存储在-80°C冰箱中。
2. 组织粉碎:
- 将植物样本放入一个冰冻的研钵或离心管中。
- 使用液氮或干冰研磨样本,使其快速细粉化。
3. 加入 TRIzol:
- 将粉碎后的样本转移到一个离心管中。
- 按照 TRIzol试剂的说明,加入适量的 TRIzol,通常是样本重量的10倍。
4. 细胞裂解:
- 用离心管盖盖好离心管,反复颠倒混合样本和 TRIzol。确保样本充分悬浮在 TRIzol中。
- 将样本在室温下静置5分钟,使 TRIzol充分裂解细胞壁,并使 RNA完全溶解。
5. 添加有机溶剂:
- 加入等体积的氯仿到离心管中。
- 盖子盖好离心管并轻轻摇晃5分钟,使 TRIzol 分为两相。
6. 离心分层:
- 使用离心机以最大速度(12000-15000 x g)离心离心管15分钟。
- 离心后,会形成两个相:上层为澄清的上清液,中间为白色的亚相,下层为红色的有机相。
7. 收集上清液:
- 使用移液器将上清液(上层透明相)小心地转移至一个新的 RNase-free 离心管中。
8. 沉淀 RNA:
- 加入 等体积的异丙醇(isopropanol)到上清液中,并混合均匀。
- 在室温下静置10分钟,使 RNA 沉淀。
9. 离心和洗涤:
- 使用离心机以最大速度(12000-15000 x g)离心离心管10分钟。
- 倒出上清液,然后使用75%无水乙醇进行一次洗涤,倒出乙醇。
- 再次使用离心机以最大速度(12000-15000 x g)离心离心管5分钟,去除余留的乙醇。
10. 空气干燥和溶解:
- 在室温下放置 RNA 沉淀离心管中,使其自然空气干燥。
- 使用RNase-free水或缓冲液溶解RNA沉淀。根据进一步实验的需要,可以使用DEPC水或Tris-EDTA缓冲液溶解RNA。
需要注意的是,在整个植物总RNA提取的过程中,一定要严格遵循RNase-free操作,并尽量避免RNA的降解。每个实验室可能会有一些细微的差异,因此最好根据试剂盒厂商的建议和实验室的特定要求进行调整。