甲基化检测
甲基化检测
服务介绍
DNA 甲基化是表观遗传学(Epigenetics)的重要组成部分,是最具特点的表观遗传学修饰,在人的正常发育、X 染色体失活、衰老以及许多人类疾病(如发育畸形、癌症、心血管疾病、糖尿病和神经心理失调等)发生过程中发挥重要作用。DNA 甲基化是在DNA 甲基化转移(DNMTs)的作用下使CpG 二核苷酸5' 端的胞嘧啶转变为5' 甲基胞嘧啶,在基因组的某些区域中,通常位于基因的启动子区或是第一个外显子区,CpG 序列密度很高,可以达均值的5 倍以上。
服务内容
1、BSP法
亚硫酸氢盐处理后测序法(bisulfite sequencing PCR,BSP)是检测基因甲基化的经典方法,其原理为:用亚硫酸氢钠修饰处理基因组DNA,所有未发生甲基化的胞嘧啶(C)被转化为尿嘧啶(U)而甲基化的胞嘧啶则不变。用亚硫酸氢盐处理基因组DNA,所有未发生甲基化的胞嘧啶被转化为尿嘧啶,而甲基化的胞嘧啶不变;随后在CpG岛两端设计引物进行PCR扩增,将目的产物纯化后进行TA克隆,每个克隆挑取阳性克隆测序,最后将测得的序列与原始序列比对,统计甲基化位点及数量,并分析甲基化程度。
2、MSP法
重亚硫酸盐处理DNA后,基因组DNA发生的由甲基化状态决定的序列改变,随后进行引物特异性的PCR。MSP中设计两对引物,一对结合处理后的甲基化DNA链(引物对M),另一对结合处理后的非甲基化DNA链(引物对U)。检测MSP扩增产物,如果用引物M能扩增出片段,则说明检测位点存在甲基化;若用引物U扩增出片段,则说明被检测的位点不存在甲基化。
我们提供
原始数据、结果分析及完整的实验步骤