胶条质谱鉴定

胶条质谱鉴定

蛋白胶条鉴定是目前使用最广泛的蛋白质组学研究手段，用双向电泳(Two-dimensional gel electrophoresis，2-DE)和聚丙烯酰胺凝胶电泳（SDS-PAGE，Sodium Dodecyl Sulfate Polyacrylamide Gel Electrophoresis）分离蛋白质混合物，收集目的蛋白质胶点和胶条，经胶内酶解后用于质谱分析以获得蛋白质信息。

将蛋白条带在胶内酶切成肽段混合物，提取肽段混合物之后使用LC-MS/MS鉴定。肽段在质谱仪中离子化后，会带上一定量的电荷，通过检测器分析，可得到各肽段的质荷比(m/z)，从而得知各肽段的相对分子质量。为获得肽段的序列信息，质谱仪会选取某些肽段进行破碎，再次分析，获得二级质谱，检索软件根据二级质谱信息与相应的数据库比对，结合匹配度打分及错配过滤，可得到肽段的确切序列，进而拼接出各蛋白的完整序列，从而实现对蛋白的鉴定。