10x单细胞测序是什么意思

10x单细胞测序是一种常用的单细胞测序技术,利用10x Genomics公司的设备和试剂盒进行实验。它采用了一种被称为GEM(Gel Bead in Emulsion)技术。

 

在10x单细胞测序中,单个细胞被封装在小水滴中,每个水滴内都包含了一颗称为“GEM bead”的磁珠。这些磁珠上覆盖有一系列的条形码,用于标识不同细胞的来源。在细胞裂解和反转录的过程中,每个细胞的mRNA被转录成cDNA,并连在磁珠上。这样,每个磁珠上都带有来自同一细胞的cDNA,同时带有一个唯一的条形码。

 

经过扩增和建库后,磁珠上的cDNA被用于高通量测序。通过解码条形码,可以对每个细胞的转录组数据进行分离和分析。10x单细胞测序具有以下优点:

 

1. 高通量:可以同时测序上千个单个细胞,获得大规模的单细胞转录组数据。

 

2. 高灵敏度:能够检测到低表达基因,包括转录因子和细胞标记基因等。

 

3. 低成本:相对于传统的单细胞测序方法,10x单细胞测序具有较低的试剂费用和测序成本。

 

4. 数据高质量:由于每个细胞的cDNA都与唯一的条形码相关联,可以有效地消除PCR扩增引入的偏差和误差。

 

10x单细胞测序广泛应用于细胞组学研究、发育生物学、疾病研究等领域,为揭示细胞异质性、细胞亚型、细胞发展轨迹等提供了有力的工具和数据支持。

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