tmt标记定量蛋白质组学原理
TMT标记定量蛋白质组学是基于质谱的定量方法,通过使用TMT(Tandem Mass Tag)化学试剂对蛋白质样品进行化学标记,以实现在质谱分析中对不同样本中蛋白质的定量。
TMT标记定量蛋白质组学的原理如下:
1. 样品消化:首先将蛋白质样品消化成肽段。这可以通过使用酶(如胰蛋白酶)将蛋白质酶解成小片段。
2. TMT标记:然后,使用不同的TMT试剂对不同样本中的肽段进行化学标记。TMT试剂是一种含有特定质量标记的化学结构的试剂。多个样本可以使用不同的TMT试剂进行标记。TMT试剂中的标记基团可以与肽段中的游离氨基基团反应形成酰胺键。通过不同TMT标记试剂的质量标签,可以在质谱中区分具有不同标签的肽段。
3. 样品混合:所有经过TMT标记的样本被混合在一起,形成一个复杂的蛋白质混合物。
4. 高性能液相色谱-质谱(LC-MS/MS)分析:将混合样品通过高性能液相色谱(LC)进行分离,然后将肽段逐个离子化并进行质谱分析。质谱仪将测量每个肽段的质荷比和其强度。
5. 数据分析:通过分析质谱数据,可以计算不同样本中蛋白质的相对表达水平。通过比较不同标记TMT试剂的质谱信号强度,可以推导出不同样本中蛋白质的定量信息。
总之,TMT标记定量蛋白质组学利用TMT试剂对多个样本中的肽段进行化学标记,并通过质谱分析来定量不同样本中的蛋白质。它具有高通量、高灵敏度和准确性的优势,是一种常用的蛋白质组学定量方法。