RNA粗品如何进一步纯化

RNA是一种重要的生物大分子,它在生物体内的作用非常重要,包括遗传控制、基因表达和翻译等。因此,随着现代生物学的发展,越来越多的生物学家们需要从样品中提取RNA,并对RNA进行研究分析。但是,从样品中提取出的RNA通常存在一定的杂质,需要进一步纯化。本文介绍了常用的RNA粗品纯化方法。

 

一、氯仿抽提法

氯仿抽提法是一种常见的RNA纯化方法。将粗品RNA加入等体积的氯仿中,摇匀混合,然后离心分离。RNA会分布在上层水相中,而DNA和蛋白质会分布在下层有机相中。收集上层的水相,添加同体积的异丙醇或乙醇,沉淀RNA,然后用75%的乙醇洗涤,最后在空气中晾干或真空干燥即可。

 

此方法原理简单,操作易行,可以提取RNA且纯度较高,但需要注意的是,必须将氯仿和水完全分离,否则会导致RNA的丢失或降解。此外,该方法不适用于从一定数量的组织或细胞中提取RNA

 

二、酚/氯仿/异戊酮法

/氯仿/异戊酮法是一种粗品RNA纯化方法。先将RNA粗品置于酚/氯仿/异戊酮混合液中,并离心分离。RNA分子会分布在上层的酚相中,没有结合的DNA和蛋白质则分布在异戊酮相中。然后收集上层的酚相,用缩醛或异丙醇沉淀RNA即可。如果需要提高RNA纯度,仍需用浓盐溶液(如3M NaCl)或酸性异丙醇进行提纯。

 

优点是纯化效果好,适用于细胞和组织样品的提取,吸附剂容易得到。但是,缺点是该方法的操作时间长,不利于大规模应用。

 

三、离心柱层析法

离心柱层析法是一种比较先进的RNA粗品纯化方法。它使用专门的RNA萃取剂或吸附剂,可以在不影响RNA转录或逆转录效率的情况下去除RNA中的杂质。与其他大多数RNA纯化方法不同,此方法也适用于一定量的细胞和组织样品。

 

层析柱的选择主要取决于RNA分子的长度、质量和目标。对于较短的RNA分子,小柱子具有更好的精度和灵敏度,而大柱子可以用于长RNA的制备。吸附剂包括硅胶、玻璃纤维、树脂和磁性微珠等。

 

该方法优点是操作简单方便、减少RNA剪切和降解,可以少量高质量的RNA提取,缺点是吸附剂成本高、柱子容易堵塞和使用寿命短。

 

四、硅胶膜法

硅胶膜法是一种高效的RNA粗品纯化方法。该方法的原理是,RNA分子与硅胶膜上的固相有较强的疏水作用,而杂质如DNA、蛋白质等则不会与其结合。硅胶膜可分为细颗粒和大板两种。硅胶膜法适用于RNA精炼和小RNA的分离。

 

首先将RNA粗品放置于硅胶膜上,然后利用不同的缓冲液洗去各种杂质,并用酒精等溶剂进行洗脱。优点是使用方便、处理大量样品、提取高质量RNA,缺点是硅胶膜的材质会影响RNA的浓度和复性,以及RNA分子过长,有较强的干扰作用。

 

RNA粗品纯化的方法有多种,每种方法都有其优缺点。选择哪种方法,要考虑RNA样品的来源、目的以及实验室设备和预算等因素。以上介绍的氯仿抽提法、酚/氯仿/异戊酮法、离心柱层析法和硅胶膜纯化法是目前最常用的几种方法,可以根据实验需要进行选择。

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