miRNA、lncRNA、circRNA傻傻分不清？
大家都知道，RNA世界有三宝：miRNA、lncRNA和circRNA。无论是其中哪一个，均有众多的科研者对其进行孜孜不断的探索与追求。
miRNA, lncRNA, circRNA都是RNA，区别在于miRNA是小RNA，长度较短，20~25个核苷酸；lncRNA是长链非编码RNA，长度较长，大于200核苷酸，circRNA是环状RNA，一般呈环状。下面就具体分析一下，它们究竟哪儿不一样。
1. 数据库不同
针对miRNA用miRbase，针对lncRNA用Noncode，针对circRNA用circBase或circRNABase。
2. 命名规则不同
miRNA研究较多，也有一套熟知的命名体系。一个系统命名包含三部分内容，即物种、microRNA类别、序号。三者间用短线连接。物种一般用三个小写字母表示，如hsa,mmu分别代表人、小鼠。microRNA类别是指所命名的microRNA是pre-miRNA还是mature miRNA。pre-miRNA用mir表示，mature miRNA用miR表示。序号为一阿拉伯数字，c先后。一般而言，数字越小，发现越早。
对于lncRNA和circRNA来说，目前还没有一个既定的命名规则，简单说，如果你新发现了一个lncRNA或circRNA，那你想给它取什么名字都可以，只要别和其他的重复就可以了。
3. 物种选择需谨慎
miRNA一般物种保守性较好，就是说，在人和鼠上，都是同一个序列，可以做鼠的实验，来推测在人身上的功能。circRNA 的表达水平具有种属、组织、时间特异性，序列保守性比一般的线性lncRNA 高，和miRNA一样，可以用同一个序列去研究人和鼠。而lncRNA，物种的保守性就比较差一些了。如果你研究的是已知的lncRNA，那你需要上网查查它的保守性，如果是未知的，需要探讨一下它的保守性。
4. 方法选择不同
miRNA较短，稳定性好，不易被破坏。可以选择Northern印迹法，微点阵分析和荧光定量PCR。lncRNA长度较长，做Northern印迹的难度大，选用荧光定量PCR或荧光原位杂交。circRNA和lncRNA一样，一般选用荧光定量PCR或荧光原位杂交。毕竟荧光原位杂交图能显示出RNA的亚细胞定位，是在胞浆还是在核里。但是做miRNA一般不做定位，因为miRNA就是成熟的miRNA了，它是从pri-miRNA到pre-miRNA到miRNA，已经从核内转移到了胞浆里了。
研究RNA时，需要进行过表达和沉默操作。miRNA 很小，转染操作较方便，过表达的时候可以用mimics（模拟物），沉默的时候可以用inhibitor（抑制物）。用质粒或者病毒都可以达到稳定转导的效果。
对于lncRNA和circRNA。核定位的lncRNA如果用RNAi 技术，效果是很差的，因为RNAi主要在细胞浆发挥作用。替代的方式可以用CRISPR基因编辑技术，直接把lncRNA的基因knockout。这里需要注意的一点是circRNA是环状RNA，虽然在研究手段和机制上面，大多和lncRNA相类似，但是它需要论证成环的问题。
5. 热度不同
目前研究得最为深入的应该是miRNA了，当然这也意味着它已经渐渐退出了历史舞台。当前的研究，lncRNA红到发紫，肿瘤相关的lncRNA研究，5分以上很常见。circRNA算是新秀，正在各个实验室里酝酿，谁先有突破性的进展，谁就可以占领高地。
最后说说相同点，第一就是，这三个都是非编码RNA不需要蛋白水平的验证。第二，既然都是RNA，发挥作用的阶段也就要么转录前，要么转录时，要么转录后。第三，对mRNA起调控作用。
那植物microrna如何提取呢？
核小体（北京）生物技术有限公司推出的植物microRNA提取试剂盒能实现植物总RNA和microRNA共提。
独特的裂解液迅速裂解细胞和灭活细胞 RNA 酶，植物 RNA 助提剂 PLANTaid 帮助结合多糖多酚并通过离心去除，然后裂解混合物通过基因组 DNA 清除柱，基因组 DNA 被清除而 RNA（包括 microRNA）被选择性滤过。滤过的 RNA 用乙醇调节结合条件后，RNA 在高离序盐状态下选择性吸附于离心柱内硅基质膜， 再通过一系列特殊漂洗液快速的漂洗－离心的步骤 , 将细胞代谢物、蛋白等杂质去除， 最后低盐的 RNase free H20 将纯净 RNA（包括 microRNA）从硅基质膜上洗脱。
另外采用分提取操作步骤也可单独纯化富集后的 microRNA 组分和总 RNA（>200 nt）从而得到分离富集的 microRNA 和 RNA。
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